Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDT1Q9H211 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDT1Q9H211 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDT1Q9H211 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDT1Q9H211 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms