Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E3

SAP130, Histone deacetylase complex subunit SAP130, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP130Q9H0E3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAP130Q9H0E3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAP130Q9H0E3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms