Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NBPF3Q9H094 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NBPF3Q9H094 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF3Q9H094 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF3Q9H094 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms