Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SPEF2Q9C093 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SPEF2Q9C093 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SPEF2Q9C093 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SPEF2Q9C093 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms