Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80BQ9C086 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
INO80BQ9C086 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80BQ9C086 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms