Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM2Q9C040 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM2Q9C040 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms