Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBXN6Q9BZV1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBXN6Q9BZV1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN6Q9BZV1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms