Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MGME1Q9BQP7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms