Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C19orf43Q9BQ61 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C19orf43Q9BQ61 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C19orf43Q9BQ61 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms