Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM7Q9BQ49 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM7Q9BQ49 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM7Q9BQ49 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM7Q9BQ49 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms