Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MEIS3Q99687 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MEIS3Q99687 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MEIS3Q99687 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MEIS3Q99687 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MEIS3Q99687 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms