Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VAT1Q99536 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAT1Q99536 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms