Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CRBNQ96SW2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CRBNQ96SW2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CRBNQ96SW2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms