Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
IFT140Q96RY7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
IFT140Q96RY7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
IFT140Q96RY7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC41.81■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
IFT140Q96RY7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC41.7■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC41.7■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
IFT140Q96RY7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
IFT140Q96RY7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
IFT140Q96RY7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
IFT140Q96RY7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
IFT140Q96RY7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
IFT140Q96RY7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
IFT140Q96RY7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
IFT140Q96RY7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
IFT140Q96RY7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.64■■■■■ 4.26
IFT140Q96RY7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
IFT140Q96RY7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
IFT140Q96RY7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms