Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP5Q96RT8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP5Q96RT8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP5Q96RT8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP5Q96RT8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms