Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSPG4P5Q96PW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPG4P5Q96PW8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPG4P5Q96PW8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPG4P5Q96PW8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms