Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
JSRP1Q96MG2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
JSRP1Q96MG2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JSRP1Q96MG2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JSRP1Q96MG2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms