Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJD4Q96KN9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GJD4Q96KN9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GJD4Q96KN9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GJD4Q96KN9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GJD4Q96KN9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms