Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VCPIP1Q96JH7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCPIP1Q96JH7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VCPIP1Q96JH7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms