Protein–RNA interactions for Protein: Q96H72

SLC39A13, Zinc transporter ZIP13, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A13Q96H72 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A13Q96H72 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A13Q96H72 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A13Q96H72 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A13Q96H72 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A13Q96H72 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms