Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDXPQ96GD0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDXPQ96GD0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms