Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX7

TRMT61A, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase catalytic subunit TRMT61A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61AQ96FX7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT61AQ96FX7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT61AQ96FX7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT61AQ96FX7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms