Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEIL1Q96FI4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEIL1Q96FI4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEIL1Q96FI4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms