Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EDC3Q96F86 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
EDC3Q96F86 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EDC3Q96F86 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms