Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MVB12AQ96EY5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MVB12AQ96EY5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MVB12AQ96EY5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MVB12AQ96EY5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms