Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23CQ96ET8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TVP23CQ96ET8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms