Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATG4CQ96DT6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG4CQ96DT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG4CQ96DT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG4CQ96DT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms