Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERP27Q96DN0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERP27Q96DN0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms