Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAF2Q96CS3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAF2Q96CS3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAF2Q96CS3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAF2Q96CS3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FAF2Q96CS3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAF2Q96CS3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAF2Q96CS3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAF2Q96CS3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms