Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VOPP1Q96AW1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VOPP1Q96AW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VOPP1Q96AW1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms