Protein–RNA interactions for Protein: Q96A44

SPSB4, SPRY domain-containing SOCS box protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB4Q96A44 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SPSB4Q96A44 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPSB4Q96A44 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPSB4Q96A44 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms