Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTSSAQ969W0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTSSAQ969W0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms