Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIFAP3Q92845 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIFAP3Q92845 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFAP3Q92845 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KIFAP3Q92845 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms