Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6NLQ92738 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP6NLQ92738 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6NLQ92738 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6NLQ92738 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP6NLQ92738 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP6NLQ92738 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6NLQ92738 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6NLQ92738 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6NLQ92738 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms