Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCDQ92629 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCDQ92629 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms