Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113Q902F9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113Q902F9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERVK_113Q902F9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERVK_113Q902F9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms