Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSPC1Q8WXF1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSPC1Q8WXF1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms