Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GAB3Q8WWW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GAB3Q8WWW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GAB3Q8WWW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAB3Q8WWW8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms