Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG1Q8WVM7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG1Q8WVM7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
STAG1Q8WVM7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG1Q8WVM7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms