Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRN4Q8WUT4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRN4Q8WUT4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRN4Q8WUT4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms