Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC3Q8TF64 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIPC3Q8TF64 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GIPC3Q8TF64 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms