Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3RF2Q8TEC5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3RF2Q8TEC5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3RF2Q8TEC5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms