Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB33

LINC01560, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01560, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01560Q8TB33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC01560Q8TB33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC01560Q8TB33 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC01560Q8TB33 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC01560Q8TB33 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms