Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT6

NPLOC4, Nuclear protein localization protein 4 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPLOC4Q8TAT6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPLOC4Q8TAT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NPLOC4Q8TAT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPLOC4Q8TAT6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPLOC4Q8TAT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms