Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
RDM1Q8NG50 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RDM1Q8NG50 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RDM1Q8NG50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RDM1Q8NG50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RDM1Q8NG50 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms