Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC9Q8N567 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC9Q8N567 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC9Q8N567 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC9Q8N567 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms