Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4F7

RNF175, RING finger protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF175Q8N4F7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF175Q8N4F7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF175Q8N4F7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF175Q8N4F7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms