Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GPC2Q8N158 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPC2Q8N158 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPC2Q8N158 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPC2Q8N158 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms