Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC103Q8IW40 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC103Q8IW40 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC103Q8IW40 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms