Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR0

TRAPPC5, Trafficking protein particle complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5Q8IUR0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC5Q8IUR0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC5Q8IUR0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC5Q8IUR0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms